Askeri mahkemeler, askeri personelin işlediği suçları yargılar ve askeri disiplin kurallarını uygular. Sivil mahkemeler ise genel halkın ve diğer tüm kişilerin suçlarını ve hukuki ihtilaflarını çözer. Türkiye’de askeri mahkemelerin yetkileri sınırlandırılmış ve 2017 sonrası önemli değişiklikler olmuştur. Günümüzde askeri mahkemeler daha çok disiplin suçlarına bakar. Sivil mahkemeler ise geniş kapsamlıdır ve temel adalet mekanizmasıdır.