Müsteşar yardımcısı, bakanlığın üst düzey bürokratlarından biridir ve idari işlerin yürütülmesinde müsteşara destek verir. Siyasi kariyer yerine bürokratik bir konumdadır. Bakan danışmanı ise bakanın siyasi ve hukuki işlerinde yardımcı olan kişidir, siyasi bir pozisyon olabilir. Müsteşar yardımcısı idari karar süreçlerinde aktifken, bakan danışmanı daha çok stratejik tavsiyeler verir. Görev ve statüleri birbirinden ayrılır.